Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CopeO89079 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopeO89079 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopeO89079 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopeO89079 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopeO89079 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopeO89079 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopeO89079 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CopeO89079 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopeO89079 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopeO89079 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopeO89079 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopeO89079 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopeO89079 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CopeO89079 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CopeO89079 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CopeO89079 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms