Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms