Protein–RNA interactions for Protein: O88855

Ltb4r, Leukotriene B4 receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb4rO88855 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ltb4rO88855 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltb4rO88855 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltb4rO88855 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltb4rO88855 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ltb4rO88855 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltb4rO88855 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ltb4rO88855 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms