Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ShdO88834 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ShdO88834 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ShdO88834 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ShdO88834 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ShdO88834 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ShdO88834 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ShdO88834 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ShdO88834 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
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