Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hcn3O88705 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hcn3O88705 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hcn3O88705 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hcn3O88705 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hcn3O88705 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hcn3O88705 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hcn3O88705 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hcn3O88705 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hcn3O88705 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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