Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BlmO88700 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BlmO88700 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BlmO88700 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BlmO88700 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BlmO88700 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BlmO88700 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms