Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pak1O88643 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pak1O88643 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms