Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnmt3aO88508 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms