Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vamp4O70480 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms