Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SfnO70456 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SfnO70456 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SfnO70456 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SfnO70456 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SfnO70456 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SfnO70456 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SfnO70456 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SfnO70456 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SfnO70456 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms