Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb5O70309 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms