Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms