Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms