Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg2O55111 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms