Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms