Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc3O55013 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms