Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn5O54942 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn5O54942 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms