Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DffaO54786 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DffaO54786 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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DffaO54786 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DffaO54786 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DffaO54786 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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DffaO54786 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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DffaO54786 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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DffaO54786 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DffaO54786 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DffaO54786 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms