Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms