Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sdc4O35988 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sdc4O35988 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sdc4O35988 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sdc4O35988 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdc4O35988 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdc4O35988 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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