Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab33bO35963 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rab33bO35963 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rab33bO35963 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab33bO35963 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms