Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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