Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lhx8O35652 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms