Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Opn1mwO35599 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Opn1mwO35599 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms