Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sema6aO35464 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema6aO35464 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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