Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms