Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd2O35392 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd2O35392 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd2O35392 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd2O35392 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms