Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kpna6O35345 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms