Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf5O35326 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf5O35326 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf5O35326 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf5O35326 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf5O35326 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf5O35326 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf5O35326 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf5O35326 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf5O35326 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf5O35326 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf5O35326 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms