Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2O35245 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms