Protein–RNA interactions for Protein: O35188

Cx3cl1, Fractalkine, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cl1O35188 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cx3cl1O35188 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Cx3cl1O35188 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cx3cl1O35188 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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