Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe40O35185 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms