Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Nedd9O35177 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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