Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ArxO35085 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ArxO35085 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ArxO35085 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ArxO35085 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ArxO35085 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ArxO35085 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ArxO35085 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ArxO35085 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ArxO35085 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms