Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eftud2O08810 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms