Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CltaO08585 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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CltaO08585 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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CltaO08585 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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CltaO08585 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CltaO08585 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltaO08585 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltaO08585 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms