Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
U90926O08546 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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U90926O08546 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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U90926O08546 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
U90926O08546 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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U90926O08546 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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U90926O08546 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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U90926O08546 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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U90926O08546 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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U90926O08546 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
U90926O08546 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
U90926O08546 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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