Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MsmbO08540 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MsmbO08540 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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