Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm17078M0QW51 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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