Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC117090L7N257 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC117090L7N257 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms