Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700122O11RikJ3QPW6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700122O11RikJ3QPW6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms