Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10428J3QNV7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms