Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm20918J3QN17 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gm20918J3QN17 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm20918J3QN17 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm20918J3QN17 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm20918J3QN17 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm20918J3QN17 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20918J3QN17 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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