Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3415J3QMS8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm3415J3QMS8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm3415J3QMS8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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