Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn34c3J3QJW5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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