Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm21897J3KMP5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm21897J3KMP5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm21897J3KMP5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21897J3KMP5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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