Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm20830J3KML6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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