Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G3

Opcml, MCG9827, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpcmlG5E8G3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
OpcmlG5E8G3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OpcmlG5E8G3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms