Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r67G5E8C1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms