Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc3h12bG3X9I7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms